Protein–RNA interactions for Protein: O94822

LTN1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, humanhuman

Predictions only

Length 1,766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1O94822 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTN1O94822 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTN1O94822 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTN1O94822 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTN1O94822 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTN1O94822 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTN1O94822 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTN1O94822 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTN1O94822 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTN1O94822 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTN1O94822 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTN1O94822 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTN1O94822 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTN1O94822 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTN1O94822 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTN1O94822 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTN1O94822 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTN1O94822 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTN1O94822 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTN1O94822 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTN1O94822 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LTN1O94822 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTN1O94822 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTN1O94822 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTN1O94822 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTN1O94822 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTN1O94822 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTN1O94822 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTN1O94822 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTN1O94822 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTN1O94822 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LTN1O94822 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTN1O94822 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTN1O94822 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LTN1O94822 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTN1O94822 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LTN1O94822 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTN1O94822 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTN1O94822 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTN1O94822 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTN1O94822 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTN1O94822 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTN1O94822 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTN1O94822 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTN1O94822 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTN1O94822 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LTN1O94822 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTN1O94822 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTN1O94822 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTN1O94822 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTN1O94822 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LTN1O94822 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LTN1O94822 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LTN1O94822 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTN1O94822 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTN1O94822 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LTN1O94822 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LTN1O94822 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms