Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNKO75909 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNKO75909 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNKO75909 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNKO75909 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNKO75909 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNKO75909 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNKO75909 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNKO75909 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNKO75909 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNKO75909 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNKO75909 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms