Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRMUO75648 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRMUO75648 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRMUO75648 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRMUO75648 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRMUO75648 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRMUO75648 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRMUO75648 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRMUO75648 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRMUO75648 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRMUO75648 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRMUO75648 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRMUO75648 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRMUO75648 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRMUO75648 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRMUO75648 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRMUO75648 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRMUO75648 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRMUO75648 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRMUO75648 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms