Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB11FIP3O75154 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms