Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPFIA3O75145 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms