Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMDSO60547 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms