Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPLO60437 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPLO60437 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPLO60437 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPLO60437 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPLO60437 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPLO60437 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPLO60437 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPLO60437 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPLO60437 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPLO60437 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPLO60437 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPLO60437 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPLO60437 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PPLO60437 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPLO60437 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPLO60437 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPLO60437 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPLO60437 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPLO60437 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PPLO60437 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPLO60437 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPLO60437 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPLO60437 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPLO60437 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPLO60437 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPLO60437 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PPLO60437 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPLO60437 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PPLO60437 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPLO60437 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPLO60437 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPLO60437 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPLO60437 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPLO60437 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPLO60437 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms