Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB3O43889 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB3O43889 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB3O43889 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB3O43889 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB3O43889 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB3O43889 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB3O43889 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB3O43889 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB3O43889 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB3O43889 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB3O43889 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB3O43889 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB3O43889 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB3O43889 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB3O43889 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB3O43889 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB3O43889 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB3O43889 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB3O43889 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB3O43889 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB3O43889 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB3O43889 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB3O43889 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms