Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAP23O00161 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAP23O00161 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms