Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms