Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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