Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF316A6NFI3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF316A6NFI3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms