Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP5LA4QPB2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms