Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms