Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MAP3K4Q9Y6R4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms