Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX8Q9Y5X2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms