Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNX6Q9UNH7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms