Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNMA8BQ9ULN7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms