Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXD3Q9UJU5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms