Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY5

LPAR3, Lysophosphatidic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR3Q9UBY5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPAR3Q9UBY5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms