Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL9Q9P2J3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms