Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms