Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX00

TMEM160, Transmembrane protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM160Q9NX00 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM160Q9NX00 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM160Q9NX00 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms