Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREX1Q9NSU2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREX1Q9NSU2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms