Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms