Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms