Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM3Q9NNZ6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms