Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms