Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms