Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms