Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM55Q9BYV6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms