Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSDMCQ9BYG8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms