Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP3Q9BWW4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms