Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH2

FUNDC2, FUN14 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC2Q9BWH2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FUNDC2Q9BWH2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms