Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NICN1Q9BSH3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms