Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP8Q99708 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms