Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms