Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEDD4LQ96PU5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms