Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
COG8Q96MW5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COG8Q96MW5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms