Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC35A4Q96G79 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms