Protein–RNA interactions for Protein: Q96A58

RERG, Ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERGQ96A58 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RERGQ96A58 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RERGQ96A58 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms