Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBE2E3Q969T4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms