Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms