Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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GTF3C6Q969F1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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GTF3C6Q969F1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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GTF3C6Q969F1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3C6Q969F1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
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