Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO1Q92973 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms