Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF3AQ92664 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms