Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms