Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSH3Q8TE77 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSH3Q8TE77 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms