Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNDC9Q8TBE3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms