Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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TMIEQ8NEW7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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TMIEQ8NEW7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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TMIEQ8NEW7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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TMIEQ8NEW7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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TMIEQ8NEW7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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TMIEQ8NEW7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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TMIEQ8NEW7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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TMIEQ8NEW7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIEQ8NEW7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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